（？—485？）南朝宋﹑齐间文人。祖籍兰陵（今属山东），宋初土断属丹阳，后属兰陵（今江苏常州）。少举丹阳郡孝廉，为宋孝武帝所知。大明五年（461），敕助徐爰撰国史。孝武帝崩，为江夏王义恭掌书记。明帝立，使参诏诰。为王彧镇军参军。后废帝元徽初，桂阳王休范欲迎之至寻阳，巨源因萧道成使留京都。休范反，道成使巨源撰符檄，事平，除奉朝请。巨源望封赏，不获，上书袁粲，未获申。顺帝升明时，沈攸之事起，又为尚书符荆州，仍不获赏。齐高帝建元中为尚书主客郎诸职，除武昌太守，不乐西上，乃改为余杭令。武帝永明初，作《秋胡诗》，有饥刺语，被杀。

丘巨源有集十卷，录一卷，唐修《隋书》时已佚。今存诗二首，逯钦立辑入《先秦汉魏晋南北朝诗》；文三篇，严可均辑入《全上古三代秦汉三国六朝文》。